河马是性成熟动物，可以进行生殖。雌河马每年会产下一胎幼仔。雄河马的生殖器官包括阴茎和睾丸。雌河马的生殖器官包括卵巢和子宫。
繁殖期通常在春季和夏季。在这段时间内，雄河马会向雌河马发出性信号，表示其处于可繁殖状态。雌河马通常会接受雄河马的性信号，并与之交配。雄河马会用其阴茎将精子注入雌河马的子宫内。
如果受精成功，雌河马的卵子就会受到精子的融合，形成受精卵。受精卵在雌河马的子宫内发育成胚胎，最终孕妇在约12个月后生下一只幼仔。新生的河马通常长得很小，体重约为50-70公斤。它们在出生后几天内就能站立起来，并开始吃草。
河马是保护措施特别严格的动物，在自然界中，它们的繁殖率并不高。但是，在人类的保护下，河马的繁殖率得到了改善。
